斑馬魚行為跟蹤系統(tǒng)(DanioVision)是一種專門設(shè)計用于跟蹤斑馬魚或其他極小型動物行為的高通量追蹤系統(tǒng)。該系統(tǒng)集成了多種功能,包括動物行為軌跡跟蹤、環(huán)境控制、刺激單元等,廣泛應(yīng)用于神經(jīng)科學(xué)、藥理學(xué)、毒理學(xué)等多個領(lǐng)域。以下是該系統(tǒng)的一些主要應(yīng)用:Susan 151~O561~O48O
1. 神經(jīng)科學(xué)研究
斑馬魚行為跟蹤系統(tǒng)可用于研究神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育和功能。例如,研究人員可以通過改變環(huán)境條件(如光暗轉(zhuǎn)換)來觀察斑馬魚幼魚的運動反應(yīng),以此來研究神經(jīng)系統(tǒng)的響應(yīng)機制。
2. 癲癇行為研究
該系統(tǒng)可以用于模擬和研究癲癇發(fā)作的行為特征。通過觀察斑馬魚在不同條件下的運動模式,研究人員可以更好地理解癲癇行為的機制。
3. 晝夜節(jié)律研究
斑馬魚行為跟蹤系統(tǒng)能夠精確記錄斑馬魚的運動活動,這對于研究生物鐘和晝夜節(jié)律非常重要。研究表明,孔板的大小可能會影響斑馬魚的晝夜節(jié)律行為,因此使用該系統(tǒng)可以探索不同孔板尺寸對斑馬魚行為的影響。
4. 運動控制和運動障礙研究
通過跟蹤斑馬魚的運動軌跡,研究人員可以研究運動控制和運動障礙相關(guān)的疾病模型。這有助于了解運動障礙的病理生理學(xué),并為相關(guān)疾病的治療提供新的思路。
5. 光遺傳學(xué)研究
斑馬魚行為跟蹤系統(tǒng)配備了光遺傳學(xué)設(shè)備,可以精確控制光刺激的時間和強度。這使得研究人員能夠在光遺傳學(xué)研究中,通過光來激活或抑制特定神經(jīng)元,從而研究其對行為的影響。
6. 藥理學(xué)和毒理學(xué)研究
該系統(tǒng)可以用于藥物篩選和毒性測試。通過觀察斑馬魚在不同藥物或毒素作用下的行為變化,研究人員可以評估藥物的效果或毒素的危害程度。
7. 高通量篩選
斑馬魚行為跟蹤系統(tǒng)支持多孔板格式,可以同時處理大量的樣本。這使得它成為高通量篩選的理想工具,適用于大規(guī)模的藥物篩選和基因功能研究。
8. 個性化定制
該系統(tǒng)可以根據(jù)研究需求進行個性化定制,包括添加聲音/震動刺激單元、頂部光刺激單元等,以滿足不同的實驗要求。
綜上所述,斑馬魚行為跟蹤系統(tǒng)在生命科學(xué)領(lǐng)域的研究中發(fā)揮著重要作用,為研究人員提供了強大的工具來探索生物體的行為和生理機制。
斑 馬 魚的基 因圖譜基本清晰且與人類有很大相似性,具有復(fù)雜的行為,正是由于這些特點,斑馬魚可作為一種很好的行為實驗研究的模式動物。在腦與認知、情緒疾病等發(fā)生發(fā)展機制和防護藥物研發(fā)領(lǐng)域具有重要的應(yīng)用價值。
斑馬魚行為實驗包括運動、認知、情緒等多種實驗,新型水箱試驗、空場試驗等是斑馬魚中最主要的焦慮行為評估試驗。
指標參數(shù)
1.B/S架構(gòu):系統(tǒng)基于B/S架構(gòu),無需安裝任何插件,輸入網(wǎng)址即可訪問使用,內(nèi)置加密登錄,不少于2種訪問線路選擇
2.支持PC、手機等移動端全功能訪問 平臺支持在線訪問,無需額外下載客戶端。實驗結(jié)果采用真實數(shù)據(jù)標記,支持在線視頻,文檔下載等多種方式查看支持PC、手機等移動端全功能訪問,實驗數(shù)據(jù)長期云端加密保存,在線查看。
3.具有安全加密算法 https請求數(shù)據(jù)加密。采用防XSS攻擊算法,過濾xss腳本注入攻擊,用hos白名單驗證機制,有效防止host偽裝攻擊,采用改進md5不可逆加密算法,加密關(guān)鍵數(shù)據(jù),防撞庫攻擊防御,登陸密碼輸入錯誤若干次后可以封號。防止用戶用工具嘗試密碼暴力破解。
4.部署:可獨立部署學(xué)校、單位機房實驗室等:
5.多用戶:可以創(chuàng)建多用戶賬號,彼此獨立數(shù)據(jù)。
6.用戶管理功能:系統(tǒng)主要有3類用戶:管理員、教師和學(xué)員。系統(tǒng)支持對這3類用戶按組織機構(gòu)可以對用戶的相應(yīng)信息進行修改、維護。的管理??梢詥蝹€添加或批量導(dǎo)入用戶,
7.在線提問功能:平臺支持由用戶在線發(fā)起提問,管理員在線幫助功能
8.、全自動化精確跟蹤并分析不少于3個點位;可同時追蹤解析24個實驗單元中的斑馬魚活動
9、可提取運動軌跡、運動時間、運動距離、等不少于30個行為指標
10.行為學(xué)實驗功能:系統(tǒng)兼容多種行為學(xué)分析實驗。單軟件可實現(xiàn)曠場、自發(fā)、強迫游泳、懸尾Y迷宮、八臂迷宮、高架迷宮、社交、懸掛、糖水偏愛、新物體識別等實驗。
11,分析實驗數(shù)據(jù)支持下載和在線觀看視頻會方,單個曠場模塊支持100多種指標包含站立,曠場模塊指標包含抬頭等縱向指標數(shù)據(jù),平臺支持云端在線對實驗進行設(shè)置,包含自定義分析區(qū)域、分析時間段等。平臺實驗可進行復(fù)制多次分析,可重復(fù)進行多次實驗,避免用戶重復(fù)操作
12.實驗?zāi)K擴展功能:平臺可對實驗?zāi)K進行定制開發(fā),實時擴展,指標個性化提取。
13.自動攝像軟件:可在無人值守情況下進行長時間錄像(7x24小時),并可按用戶指定的時間長度自動連續(xù)保存視頻文件。
14.批量設(shè)置:用戶可以通過單次創(chuàng)建實驗批量設(shè)置多視頻通用參數(shù)。視頻可以重復(fù)復(fù)制使用以實現(xiàn)單次錄制多通道分析。
15.批量復(fù)制;
16囅忙鮰報貸脈潭巖筶墴涅析方式支持批量分析、單個分析,
17.具備批處理數(shù)據(jù)功能,對于不同類別不同條件的大量實驗視頻,可進行無人值守批處理,按預(yù)先設(shè)定的參數(shù)進行自動分析并自動保存實驗結(jié)果,
18.算法與模型基于深度學(xué)習(xí)多種算法結(jié)合分析,利用用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)、循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(RNN)和Transformer,設(shè)計和構(gòu)建適合于動物關(guān)鍵點識別任務(wù)的深度學(xué)習(xí)型。
19.數(shù)據(jù)庫:平臺內(nèi)置加密標記圖片數(shù)據(jù)數(shù)十萬張,加密實驗視頻數(shù)據(jù)數(shù)千小時系統(tǒng)內(nèi)置多種算法庫,可快速為平臺進行實驗提供算法基礎(chǔ),包含橫向指標提取,縱向活動追蹤等
20.算法庫
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